バックアップ対象に「コンピュータ全体」を選択した場合、外付けのHDDはバックアップ対象に含まれません。

外付けのHDDをバックアップする場合、[バックアップ対象]を「ファイル/フォルダ」または「ディスク/ボリューム」にします。

 

[バックアップする項目] で外付けHDDを選択することが出来るようになります。